基因组测序的幕后推手 戴尔HPC破冰“精准医疗”

基因组测序的幕后推手 戴尔HPC破冰“精准医疗”

基因组数据分析是生命科学研究中一项极有可能改变未来世界的技术。戴尔联手SAP推出SAP HANA解决方案, 将基因组测序时间由此前的4天缩短为4个小时,在为病患者夺得宝贵治疗时间的同时,也加速了这项技术走向大众。

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地球人类文明发展的历史其实就是一部新技术与新工具运用的发展史。不是吗?长矛的运用让人类拥有了更充足的食物,火的应用使人类告别了茹毛饮血的原始时代,蒸汽机的发明拉开了工业革命的帷幕,汽车的出现则加速了人类社会发展的步伐......
对于人类健康而言,基因组数据分析是生命科学研究中一项极有可能改变未来世界的技术,其所带来的价值不可估量。而HPC作为一种关键工具在其中扮演了不可或缺的角色。


不久前,由戴尔联手SAP推出的SAP HANA解决方案可以有效将基因组测序时间由此前的4天缩短为4个小时,在为病患者夺得宝贵治疗时间的同时,也让这项技术加速走向大众百姓。

在某种意义上来说,戴尔HPC在技术发展上的“一小步”,推动了人类健康发展的“一大步”。

从“数天”到“数小时”戴尔HPC助基因组数据分析能力提升

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对于人类健康而言,利用高性能计算和大数据技术的强大数据处理能力,对于人类基因组进行测序和数据分析所带来的价值不可估量。例如,仅通过对血液或唾液来分析测定一个人的基因全序列,从而对其身体先天饮酒量如何、是否具有运动天赋、未来患上癌症或白血病的几率有多大等给出准确判断。同时,由于能够做到预判,因此也能够为其提前给出个性化、精准的预防和疾病治疗方案。

愿景虽然美好,但这项技术若要发展和造福大众百姓,则面临了计算能力不足的限制瓶颈问题。据悉,一个人的完全测序的基因组包含了100-1000GB的数据量。而一百万人的基因组数据量合计将达1EB(1000000TB)的数据量。要对这么庞大的数据量进行分析比对,则对于运算设备的计算能力提出了极大的挑战。


在研究初期阶段,由于受制于运算能力瓶颈的限制,进行如此数量级的数据处理工作大概需要13年的时间。在后来多年的发展中,随着运算技术及能力的不断提升,人类基因组数据分析所需时间已从“数年”缩短为“数天”。


尽管速度提升惊人,但从应用的角度出发,动辄几天的时间,再加上高昂的成本费用,使得这项技术还停留于少数“贵族”群体享用的阶段,其离普通大众需求还存在相当远的距离。


戴尔HPC对于生命科学的研究与关注有着长期的积累,在中国可以追溯到与深圳华大基因的合作上。深圳华大基因研究院作为中国的基因研究机构,其基因组分析能力处于世界领先水平,曾先后参与完成国际人类基因组计划的“中国部分”。华大基因应用于基因研究的的高性能计算集群正是过去引入戴尔M605服务器而打造的。


前不久,由戴尔联手SAP等合作伙伴研发的基于戴尔HPC的SAP HANA解决方案,为基因组数据分析时间瓶颈的打破带来了希望。据负责HPC和SAP HANA解决方案的戴尔主管介绍,这套戴尔融合基础设施可以使每个病患者的基因测序时间从之前的4天缩短为4个小时,在基因组数据分析速度上再次实现大幅提升。

戴尔HPC  SAP HANA解决方案技术“一小步”,健康“一大步”

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在今年2月底于美国拉斯维加斯举办的HIMSS16上,戴尔联合SAP等合作伙伴展示了基于戴尔HPC的SAP HANA解决方案。据悉,该方案是专为医疗专业人士增强对患者护理的新方式。借助显示设备,其通过向专业医疗人员提供及时、强大的基因组数据分析能力,从而可以针对患者提供个性化、精准的药物和治疗方案,大幅提高对于病患者疾病的治疗效果。

这一成果归功于过去数月以来,戴尔携手SAP、英特尔的共同合作和努力。基于基因组数据分析对于计算设备的速度和可靠性提出了更高的需求,戴尔联手合作伙伴致力于对健康基金会所配套的SAP基础设施进行优化。通过共同努力,戴尔与合作伙伴们一起开发了可用于提高基因组数据分析速度的全新解决方案。


戴尔推出的解决方案提供了一个经优化、预集成的高性能计算环境。其采用了强大的英特尔至强处理器和由戴尔PowerEdge服务器组成并经优化的架构。基于此融合基础设施的SAP HANA解决方案能够提供一个灵活、可扩展的临床数据仓库模型,从而可以做到数据集成管理和进行及时、快速的大规模数据分析。该解决方案可以让全球范围内的医疗机构或生命科学研究企业能够快速、可靠地分析大量的非结构数据,从而造福于人类健康。


借助基于戴尔融合基础设施SAP HANA解决方案,可全面满足基因组分析研究需求,让时间跨度再次大幅缩短,一个病患者的基因组测序及数据分析工作从之前的数天缩短为几个小时就能完成。
具有深远意义的是,处理速度的提升在为病患者争取到更多宝贵的治疗时间的同时,也拉近其与普通大众医疗需求的距离,戴尔HPC在技术发展上的“一小步”,推动了人类健康发展的“一大步”。

联手SAP创新HPC应用价值为用户构建“未来就绪IT”环境

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所周知,SAP HANA是SAP研发的新一代内存计算技术,拥有高性能的实时计算能力。戴尔HPC是一款性能强大的硬件设备,其通过软、硬结合的方式,与SAP合作推出了性能更为强劲的SAP HANA应用方案。

该应用方案可以提供与数据源无关的多用途内存应用方案软件,这些软件基于戴尔硬件进行优化配置,并通过戴尔全球服务交付给客户。人类基因组数据分析解决方案的研发推出正是基于此。


在解决方案的搭建上,戴尔PowerEdge Server R930平台作为戴尔SAP HANA解决方案的基础平台,在所有配置中统一使用。戴尔PowerEdge R930平台与SAP HANA软件相结合,使用户可以在单一系统中执行分析、性能管理和操作。同时,这些解决方案还帮助用户更快速地对目前影响运营的事件做出响应。


除了在生命科学领域的应用外,十多年来,戴尔与SAP密切协作,为多个行业的客户提供了数百种解决方案。戴尔和SAP联手提供经过优化配置的SAP HANA解决方案,其中包括硬件应用方案、预加载的软件以及戴尔全方位的服务。


通过实施戴尔的SAP HANA解决方案,组织将能够通过识别和分析各种趋势和模式,改善规划、预测并实现价格优化。该解决方案可靠且可扩展,并能够提供多种灵活配置,可以满足企业用户面对未来的具体业务需求。


总结:在社会诸多应用领域中,生命科学以及基因研究是一项面向未来、尖端的科研项目,其对于HPC的性能和可用性提出了极致的要求。


作为“未来就绪的IT”理念的倡导者,戴尔HPC通过携手SAP创新了高性能计算和基因组数据分析速度的新高度。这一阵地的夺取,在证明其作为强大计算工具拥有高性能、高可用性等特点的同时,也为其通往更多应用领域打开了大门。

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  • 在這個世界上,沒有人比我更有資格給你幸福,別人給,我不放心,你知道嗎。如果你還是不相信我,沒事,一輩子那麼長,我等你幾年又何妨。等你什麼時候想要了,告訴我,我幫你。幸福天堂line:jkk50056

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